После упразднения монастыря его храм стал приходским. Церковь, построенная в начале 18 века, находилась на углу Воздвиженки и Крестовоздвиженского переулка и была уничтожена в 1934 году.
В 1957 году переулок был переименован в честь большевика М.П.Янышева, историческое имя возвращено в 1996 г.
О нечетной стороне:
В настоящее время по нечетной стороне домов не значится.
В XVII—XVIII веках на нечётной стороне переулка стояла усадьба князя Р.Горчакова. В домах, построенных на её территории, жили актёр П.С.Мочалов, композитор П.И.Чайковский (проживал в несохранившемся доме № 7, где работал над балетом "Лебединое озеро" и музыкальным циклом "Времена года"). Здесь находилась мастерская народного художника СССР Н. П. Ульянова, где скульптор А.С.Голубкина работала в 1901 году над барельефом "Волна" для фасада Московского художественного театра по заказу С.Т.Морозова.
В 1980-х годах на месте этих домов построено здание Генерального штаба.
Примечательные объекты:
По чётной стороне:
№ 2 — доходный дом генеральши М. С. Бутурлиной (1899—1900, архитектор С. К. Родионов), флигель усадьбы Апраксиных (XVIII век). В 1906—1922 годах здесь жил философ И. А. Ильин
№ 2, стр. 4 (во дворе дома № 2) — доходный дом (1911, архитектор С. К. Родионов).
№ 4 — дом постройки середины XIX века.
№ 4 стр. 2 — жилой дом кооператива "Московский почтовик" (1927, архитектор В. Д. Глазов).
Согласно планам правительства Москвы, пятиэтажный дом площадью 3,2 тыс. м² будет реконструирован, в рамках этой реконструкции рядом будет возведён новый объект площадью 16,5 тыс. м² с парковкой.
№ 7/6, стр. 6 — от трёхэтажного кирпичного здания 1896 года постройки общей площадью сохранился лишь фрагмент стены. Правительство Москвы планирует здесь новое строительство, при этом существовавший ранее объём в 1,3 тыс. м² будет увеличен до 2,2 тыс. м², а уцелевший фрагмент старинной стены будет заключён в стеклянные объёмы.
На месте фундаментов Крестовоздвиженского храма, уничтоженного в 1934 году, планируется создание археологического парка.