Павел Николаевич Малянтович родился в 1869 году в Витебске.
Окончил гимназию в Смоленске, учился на юридическом факультете Московского университета. Участвовал в оппозиционном движении, в 1889 году привлечён к дознанию по делу о распространении революционного журнала "Самоуправление", в 1890 в течение трёх месяцев находился в тюрьме по делу "О преступном сообществе", которое велось Смоленским жандармским управлением. В 1891 отчислен из Московского университета с запрещением проживать в Москве и Московской губернии. Перешёл на юридический факультет Дерпьского (Юрьевского) университета, который окончил в 1893 году.
С 1893 — помощник присяжного поверенного, с 1898 — присяжный поверенный округа Московской судебной палаты. В 1895-1896 стал одним из создателей кружка рабочих защитников. Адвокаты не только не брали денег с клиентов, проходивших по политическим делам, но и тратили собственные средства на дорогу до места проведения процесса. К 1902 кружок превратился в группу политической защиты.
Участвовал во многих политических процессах — был защитником рабочих Морозовской фабрики (1899, из 90 подсудимых 37 были оправданы). В ходе этого процесса опровергал позицию обвинения, заключавшуюся в коллективной ответственности всех участников толпы за её действия. Защищал участников демонстраций в Сормово и Нижнем Новгороде (1902; среди его подзащитных был рабочий Павел Заломов, ставший прототипом Павла Власова, героя повести Максима Горького "Мать"), участников рабочих волнений на станции Тихорецкая (1903). В том же году успешно защищал рабочих бумагопрядильной фабрики Хлудова в Рязанской губернии (обвинение в беспорядках и сопротивлении властям) и костромских рабочих, обвинявшихся в нападении "из экономической вражды". Также был защитником обвинявшихся в беспорядках крестьян Харьковской и Полтавской губерний.
Затем был адвокатом не только рабочих, но и других революционеров — в 1904-1905 участвовал в процессе по делу Николая Баумана, Елены Стасовой и других членов Российской социал-демократической рабочей партии (РСДРП). В период революции 1905—1907 защищал членов Петербургского совета рабочих депутатов (по этому процессу проходил Лев Троцкий), участников восстания на крейсере "Память Азова" (1906. Всего провёл свыше ста политических процессов.
Вместе со своим коллегой Николаем Муравьёвым Малянтович написал книгу "Законы о политических и общественных преступлениях. Практический комментарий" (СПб, 1910). Активно сочувствовал своим подзащитным, выступал с радикальными речами на собраниях адвокатов. Участвовал в социал-демократическом движении, колебался между большевиками и меньшевиками (официально в партию не входил), постоянно находился под надзором полиции. В 1905 его квартира была явкой для Московского комитета РСДРП, членов которого защищал на процессе 1909. По данным Деппартамента полиции, в 1909 дал средства РСДРП для подкопа под тюрьму с целью освобождения заключённых.
Выиграл гражданский процесс у наследников Саввы Морозова, которые оспаривали его завещание (в нём 100 тысяч рублей завещались Марии Андреевой для передачи партии большевиков). Затем получил эти деньги по доверенности и передал их одному из лидеров большевиков Леониду Красину.
В сентябре 1917 Малянтович по предложению Александра Керенского стал министром юстиции Временного правительства (четвёртого состава). Перед этим он вступил в Российскую социал-демократическую рабочую партию (меньшевиков) с тем, чтобы представлять её в правительстве. Был примиренчески настроен по отношению к большевикам, воспринимая их как коллег по революционному движению. Несмотря на это, подписал поручение об аресте Владимира Ленина, которое так и не было исполнено. Поскольку он сам предупредил Ленина про арест для его побега и укрывательства от правосудия. Судебное заседание было назначено на октябрь 1917 г.
25 октября (7 ноября) 1917 был арестован восставшими вместе с другими членами Временного правительства, был отправлен в Петропавловскую крепость. Через день, как и другие министры-социалисты, был освобождён.
Отошёл от политической деятельности, вернулся в Москву.
В сентябре 1921 народные комиссары просвещения и юстиции Анатолий Луначарский и Дмитрий Курский (коллега Малянтовича по политической защите) вызвали его в Москву, где он служил юрисконсультом в президиуме Высшего совета народного хозяйства (ВСНХ). Вступил в Московскую коллегию защитников, которую некоторое время возглавлял, был членом первого состава президиума Всероссийской коллегии адвокатов. Участвовал в деятельности Комитета помощи политическим заключённым (.
В 1930 был арестован по делу Союзного бюро РСДРП (меньшевиков), несколько месяцев находился в Бутырской тюрьме, в мае 1931 приговорён к 10 годам лишения свободы, но затем освобождён после заступничества со стороны старых большевиков.
В ноябре 1937 вновь арестован, находился на Лубянке, в Лефортовской и Бутырской тюрьмах. Виновным себя не признал. В частности, на допросе 14 января 1939 на требование следователя дать показания о своей контрреволюционной деятельности заявил: Я намерен сегодня сказать то же, что скажу завтра и послезавтра, — что никогда контрреволюционной деятельностью не занимался, ни в каких контрреволюционных организациях не состоял и ими не руководил.
21 января 1940 Военная коллегия Верховного суда СССР приговорила Малянтовича к смертной казни.
22 января 1940 г. - казнен. Место захоронения — Новое Донское кладбище